作为新闻出版总署审定的国家一级出版社，经过四十余年的发展，北京大学出版社业已成为国内外具有重要影响力和良好声誉的大学出版社，先后荣获“全国优秀出版社”“全国先进高校出版社”“全国百佳图书出版单位”“全国文化体制改革工作先进单位”“中国出版政府奖·先进出版单位”“新闻出版走出去先进单位”“中国版权最具影响力企业”等一系列荣誉称号。连续17年被商务部、文化部、新闻出版总署等六部委评为“国家文化出口重点企业”。

1993年被中宣部、新闻出版署授予首批“全国优秀出版社”称号。

1994年被国家教委授予“全国教材管理工作先进集体”称号。

1995年被国家教委授予“全国先进高校出版社”称号。

1998年再次被中宣部、新闻出版署授予“全国优秀出版社”称号。

2002年被新闻出版总署评为“2001年度全国图书版权贸易先进单位”。

2004-2006年度连续三年被北京市版权局评为“北京地区版权贸易十佳单位”。

2006年被中国生产力学会、中国经济日报协会评为“2006最具竞争力行业十强”。

2007年被国家版权局评为“2006年度全国图书版权输出先进出版单位”；被商务部、文化部、新闻出版总署等六部委认定为“2007-2008年度国家文化出口重点企业”；被国家语言文字工作委员会授予“全国语言文字工作先进集体”称号。

2008年被北京市新闻出版局授予“北京市新闻出版版权创意成果奖（先进集体）”称号。

2009年被新闻出版总署评为国家一级出版社（全国百佳图书出版单位）；被国务院新闻办、新闻出版总署授予“中国图书对外推广计划特别奖”；被商务部、文化部、新闻出版总署等六部委认定为“2009-2010年度国家文化出口重点企业”；被新闻出版总署评为法兰克福书展中国主宾国活动“优秀活动一等奖”“版权输出先进二等奖”。

2010年被新闻出版总署评为第二届中国出版政府奖·先进出版单位。

2011年被新闻出版总署评为“新闻出版走出去先进单位”。

2012年北京大学出版社作为唯一一家大学出版社，被中共中央宣传部、文化部、国家广电总局与新闻出版总署评为“全国文化体制改革工作先进单位”；被商务部、文化部、新闻出版总署等六部委认定为 “2011-2012年度国家文化出口重点企业”；被新闻出版总署评为伦敦书展中国主宾国活动“优秀创意类”先进单位、“优秀输出类”先进单位；被北京市新闻出版局、北京市人力资源和社会保障局评为“2010-2012年度北京市新闻出版和版权工作先进集体”。 

2013年被中国版权协会授予“中国版权最具影响力企业”。

2014年被国务院新闻办、国家新闻出版广电总局授予“中国图书对外推广计划特别奖”；被商务部、中宣部、财政部、文化部、国家新闻出版广电总局认定为“2013-2014年度国家文化出口重点企业”；被《图书馆报》授予2013年全国优秀馆配商评选“十佳出版社”。

2015年被国务院新闻办、国家新闻出版广电总局授予“中国图书对外推广计划特别奖”。

2016年被商务部、中宣部、财政部、文化部、国家新闻出版广电总局认定为“2015-2016年度国家文化出口重点企业”。

2017年被国务院新闻办、国家新闻出版广电总局授予中国图书对外推广计划（2016）优秀奖第二名（单体社）。

2018年被商务部、中央宣传部、财政部、文化部、新闻出版广电总局认定为“2017-2018年度国家文化出口重点企业”。

2019年被商务部、中央宣传部、财政部、文化和旅游部、广电总局认定为“2019-2020年度国家文化出口重点企业”。

2021年被商务部、中央宣传部、财政部、文化和旅游部、广电总局认定为“2021-2022年度国家文化出口重点企业”。

2023年被商务部、中央宣传部、财政部、文化和旅游部、广电总局认定为“2023-2024年度国家文化出口重点企业”。