久久为功，善作善成。精品意识使得北京大学出版社的图书经常在各大图书奖项中榜上有名。自2012年以来，北京大学出版社共获各种出版物奖项1169项，其中国家级38项，省部级638项。

《东晋门阀政治》《全宋诗》《比较法研究》获国家图书奖；《中国文学简史》《十三经注疏》《中国经济思想通史(修订本)》《人文社会科学是什么》丛书获国家图书奖提名奖；《科学防治战胜非典》获国家图书奖特别奖；《微分几何讲义》获优秀教材国家特等奖；《马克思主义哲学史》《〈哲学笔记〉注释》《抽样论》《法学基础理论(新编本)》《光学》《泛函分析讲义》《分析动力学》《广义相对论引论》《化学动力学基础》《结构化学基础》《近代物理实验》《群论》等荣获国家优秀教材奖；《法理学》《印度古代文学史》和《北京大学物理学丛书》获国家级优秀教学成果奖；《电脑学校4(只读光盘)》获国家电子出版物奖；《国际标准汉字大字典(多媒体家庭版)》获国家电子出版物奖提名奖。

2007年，《中华文明史（共4册）》获第一届中国出版政府奖图书奖提名奖，《曹雪芹扎燕风筝图谱考工志》获第一届中国出版政府奖装帧设计奖。

2009年，《中国哲学简史》（冯友兰著/涂又光译）、《中国经济改革与股份制》（厉以宁著）、《未来之路》（[美]比尔·盖茨著 辜正坤译）、《联想为什么》（陈惠湘著）入选“改革开放30年最具影响力的300本书”和“新中国60年中国最具影响力的600本书”。

2010年，《废名集(全六卷)》获第二届中国出版政府奖图书奖，《科学的旅程（插图版）》获第二届中国出版政府奖图书奖提名奖、第三届中华优秀出版物图书提名奖。

2013年，北京大学出版社获第三届中国出版政府奖9项奖励，获奖图书涵盖哲学、历史、经济、法律、艺术等多个学科，获奖数量在全国500多家出版社中名列第一：《中国儒学史（九卷本）》《新结构经济学》获第三届中国出版政府奖图书奖；《纸》获第三届中国出版政府奖装帧设计奖；《财富论(第一､二卷)》《中国古代官阶制度引论》《中国现代美术之路》《中华人民共和国刑法的孕育诞生和发展完善》获第三届中国出版政府奖图书奖提名奖；《7+2登山日记》获第三届中国出版政府奖装帧设计奖提名奖。此外，《中国儒学史（九卷本）》荣获第四届中华优秀出版物图书奖。

2014年，《南画十六观》入选中宣部、中国图书评论学会“2013中国好书”。

2015年，《南画十六观》获得第五届中华优秀出版物图书奖；《人间词话七讲》入选中宣部、中国图书评论学会“2014中国好书”。

2016年，《家人父子——由人伦探访明清之际士大夫的生活世界》获得第六届中华优秀出版物（图书）提名奖。

2018年，《新中国60年外国文学研究(共六卷七本)》《伟大也要有人懂：一起来读毛泽东》（与中国少年儿童出版社联合出版）获第四届中国出版政府奖图书奖，《水基础科学理论与实验》获第四届中国出版政府奖图书奖提名奖。《国粹：人文传承书》入选中宣部、中国图书评论学会“2017中国好书”。

2019年，与人民出版社、中国少年儿童出版总社合作出版的《速读新时代》入选中国图书评论学会“2018中国好书”。

2019年12月，《国粹:人文传承书》获得第七届中华优秀出版物图书提名奖。

2020年，《西方博物学文化》入选中宣部、中国图书评论学会“2019中国好书”。

2021年，《书内书外：沈鹏书法十九讲》入选中宣部、中国图书评论学会“2020中国好书”。

2021年，《现代中国的述学文体》《跨文化的艺术史：图像及其重影》《d-Wave Superconductivity（d波超导体）》获得第五届中国出版政府奖图书奖提名奖。

2023年，《中华文明五千年》入选中宣部、中国图书评论学会“2022中国好书”。